Первый камень под строительство часовни заложен в селе Ишим Яйского района, рядом с разрушенной в советское время церковью Спаса Нерукотворного. Место будущего строительства освятил епископ Мариинский и Юргинский Иннокентий. В мероприятии приняли участие священнослужители, местные жители и паломники пешего крестного хода Анжеро-Судженск-Томск.
Стены старой церкви хранят память о молодом цесаревиче Николае Втором, посетившем ее во время возвращения из Японии в июле 1891 года, а также о декабристах, которые были здесь по пути в ссылку, и писателе Антоне Павловиче Чехове, направлявшемся на Сахалин.
Годы и люди не пощадили храм. Потом он был внесен в список объектов, представляющих историческую ценность. Возрождение церкви решили начать со строительства часовни. Нашлись и частные инвесторы, пообещавшие взять на себя значительную часть расходов.